Leitlinienprogramme
Die AWMF kooperiert bei der Leitlinienentwicklung in zwei Bereichen mit Partnerorganisationen in Leitlinienprogrammen:

NVL-Programm
Gemeinsam mit der Bundesärztekammer und der Kassenärztlichen Bundesvereinigung gibt die AWMF die "Nationalen Versorgungsleitlinien" heraus (NVL-Programm).
Die organisatorische und redaktionelle Umsetzung des NVL-Programms erfolgt auf Seiten der BÄK und der KBV durch das Ärztliche Zentrum für Qualität in der Medizin (äzq). Das AWMF-Institut für Medizinisches Wissensmanagement (AWMF-IMWi) organisiert die sachverständige Beratung und Unterstützung seitens der AWMF.
OL-Programm
Gemeinsam mit der Deutschen Krebshilfe und der Deutschen Krebsgesellschaft organisiert die AWMF das "Leitlinienprogramm Onkologie" (OL-Programm).